根据水质检测的要求，主要可以将检测项目分为常规指标检测和非常规指标检测，新国标也都对其进行了相应的调整。毒理学原有的指标项目也进行了相应的增加，如：无机化合物从原有的10项增加至现在的21项，有机化合物从原来仅有5项增加至53项，还有消毒剂、微生物指标等也都有所增加，这些新增的项目从很大程度上反映了我国如今对水质安全的重视。新国标项目的设置完全符合当今国际上的饮用水水质标准项目增加的趋势，并且已经基本与国际先进水质标准接轨。
新国标在原有项目的基础上做了8项修订，其中主要对浑浊度、砷、镉、铅、硝酸盐、四氯化碳着6个项目的限值要求进行了提高。另外，新国标还对总大肠菌群的测定方法与计量单位做出了修改，但却对总放射性的限值放宽了一些要求。
一般情况，地市级的供水水质检测中心，需要如下功能实验室及配套设施：
总建筑面积：2000-2500平方米，房屋最好是南北朝向、通风遮光、防尘、防震、噪音符合检验要求。
样品室：35-40平方米；
理化室：40平方米，设置两间
有机室（含气象色谱仪两台、气质联用仪一台的实验室约40平方米，有机物检测预处理室约40平方米）；
气源室：供水有机室、无机室大型设备用气（氦气、氮气、氩气、压缩空气、乙炔等）；
无机室：（含原子吸收、原子荧光光度计约占40平方米，等离子体质谱仪约占25平方米，冷却水设备约15平方米）；
离子色谱室：约20平方米；
液相室：约20平方米；
气质室：约20平方米；
分光光度室：约20平方米；
天平室：15-20平方米；
放射性室：约15平方米；
预处理室：约20平方米；
纯水室：约20平方米；
玻璃仓库：约20平方米；
无机药品仓库：约15平方米；
有机药品仓库：约15平方米；
生化室：含预处理室约20平方米、培养室约20平方米，无菌室约15平方米（洁净度要求100级）、显微镜室约20平方米；
办公室：站长室约20平方米、办公区域约60平方米、档案室约15平方米、更衣室约15平方米、会议室约40平方米、活动室约40平方米；
卫生间：每层均应设置，需男女分开。
水质化验室规划：
一楼：办公室及放射性室；
二楼：理化及微生物室；
三楼：大设备及仪器预处理室；
四楼：大设备（如液相色谱仪）及仓库。